O Programa de Promoção da Saúde tem como objetivo desenvolver ações que promovam a saúde da pessoa com deficiência intelectual e múltipla e transtorno global do desenvolvimento em seu ciclo de vida, realiza avaliação multidimensional, acompanha as ações desenvolvidas pelos diversos programas/projetos/atividades da APAE de Ibiporã e oferece atendimento de habilitação/reabilitação e prevenção.
O Setor Clínico Ambulatorial, Dr. Justino Alves Pereira, mantido pela APAE de Ibiporã, presta atendimento nas áreas médicas e paramédicas às pessoas com deficiência intelectual e múltiplas deficiências e transtornos globais do desenvolvimento, devidamente matriculadas na APAE, constituindo-se como uma equipe multiprofissional.